2000年初，秦火和温游两位年轻医生，因不同原因，来到了城乡的一间中医院。院长温博身患渐冻人病绝症，他的心愿就是培养接班人来继承自己的医学理念，服务于大众。秦火和温游的到来，让温博感到欣慰，而两个年轻人性格各异，时时引起争端，最后却互相欣赏。
秦火和温游在中医院逐渐成长，并且各自得到了自己的爱情。此时温博病发，而中医院也爆发了一场不知名的疫症，秦火最后身染这种神秘疫症而倒下。最后在温博和温游的努力下化解了危机，可惜温博却病重身亡，而他最后的遗愿就是捐献自己的遗体，让后人研究出医治渐冻人病的方法，也让秦火和温游二人明白：爱才是救人的良药，只要有爱就有希望，生命才有明天。
以不同的情感为卖点，再辅以鲜明的人物性格，现代的医学新知和传统的中医学问互相结合；糅合感情、激情、爱情、亲情、友情、悲情、动作、寓意医者之心，应先医人医心才医病，一个以仁为本的杏林故事，三十六集的感人连续剧。